对之前使用git和github的整理，重新在网上搜索资料，添加代码注释。 简介 我们一直用GitHub作为免费的远程仓库，如果是个人的开源项目，放到GitHub上是完全没有问题的。其实GitHub还是一个开源协作社区，通过GitHub，既可以让别人参与你的开源项目，也可以参与别人的开源项目。 在Gi ...

这件事情弄了我两天。查看处理错误信息占据了大部分时间。好在最后终于成功了。 感悟，对于技术文档不能完全照搬。中文的技术文档，主要的作用是了解，最后的实践一定要充分参考官方的英文文档。 基因浏览器介绍（入门）https://www.plob.org/article/11742.html 在日常数据处 ...

[TOC] 标准流程 检查md5值12md5sum -c checksums.md5# 报错,使用dos2unix转化格式 trimmomatic1234567# 2019-2-12 17:16:35 trimfor i in *_1.clean.fq.gzdo trimmomatic PE -t ...

从工业革命开始，城市化，信息化，智能化，人们的生活发生了不可逆转的剧变。有些东西消失后就不会再出现，比如蒸汽机车，有些东西即使外界再变也不会消失，比如文明。 they have given up, to a great extent, the amenities and achievements ...

DNA甲基化数据分析流程 用Trimmomatic去除低质量序列（q<20），接头。 用BSMAP比对，允许0.8的错配率。 用methratio.py提取甲基化比例，选项-r去除PCR重复。 获得DMR 为了得到可靠的DMR区域，合并两个生物学重复，仅考虑所有文库中深度至少为4的胞嘧 ...

blast2go本地化需要用到mysql，操作系统Centos 7。 1. 卸载之前的mysql之前的版本是mysql5.6，想要更新到mysql5.7。 查看mysql安装了哪些东西。 1rpm -qa |grep -i mysql 开始卸载 1yum remove XXX 查看 ...

1234567891011# 下载nr数据库，并解压# 安装nt/nr库需要进行环境变量配置，在家目录下新建一个.ncbirc配置文件nohup time update_blastdb.pl --decompress nr > out.log 2>&1 &# 同一目录下建 ...

挂载服务器里的另外两块硬盘硬盘 查看没有挂载的硬盘 fdisk -l 格式化硬盘，mkfs.ext4 /dev/sdb.报错，/dev/sdb is apparently in use by the system; will not make a 文件系统 here!。用这个命令：dmsetup ...

这篇博文写的很好 https://www.r-bloggers.com/exporting-nice-plots-in-r/
介绍的 Inkscape 也很好用，解决了之前IGV输出SVG图片的问题。导入PPT只显示一半。用Ai cc 打开，报错。“往返Tiny时剪贴将丢失”，只有框架没有图

There are two main problems when exporting graphics from R:

• Anti-aliasing is not activated in Windows R (this does not apply to Linux or Mac) – windows下没有反锯齿设置，解决：library(Cairo)
• When increasing the resolution the labels automatically decrease and become unreadable –分辨率升高，标签会自动缩小

If we want to increase the resolution of the plot we can’t just change the resolution parameter:
We also have to change the point size, the formula is size * new resolution DPI / 72 DPI:

If we double the image size we also need to double the point size:

University of Nebraska-Lincoln researchers have found revolutionary evidence that an evolutionary phenomenon at work in complex organisms is at play i ...