建立本地nr数据库 Posted on 2019-01-28 | Edited on 2019-03-03 1234567891011# 下载nr数据库,并解压# 安装nt/nr库需要进行环境变量配置,在家目录下新建一个.ncbirc配置文件nohup time update_blastdb.pl --decompress nr > out.log 2>&1 &# 同一目录下建立nr_plant子库blastdb_aliastool -seqidlist sequence.seq -db nr -out nr_plant -title nr_plant# 运行时间相当长blastp -query AT-ARR.fa -db nr -outfmt 11 -out ARR.blastp@nr.asn -num_threads 8# 测试时间time blastp -query ~/qizhengyang/AT-ARR.fa -db nr_plant -outfmt 11 -out ARR.blastp@nr.asn -num_threads 8